Olá, @silviobill!
O tempo máximo de execução do fluxo na camada servidor é especificado por aquele parâmetro que citei no post anterior.
Na instalação padrão do Webrun, o mesmo vem configurado automaticamente com 300 segundos. O que pode ser alterado para sua necessidade, pela tela de Parâmetros de Configuração do Webrun.
Em relação ao fluxo demorar de ser executado, a nível da aplicação não tem problema nenhum, o que pode impactar é se você estiver utilizando algum servidor HTTP como Apache que pode limitar o tempo das requisições e interromper a requsição quando esse tempo for ultrapassado.
Espero ter ajudado!